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某人的DNA基因序列数据

发布:可思数据 时间:2019-10-19
数据类型:图形图像 热度

文件类型:.zip              文件大小:5.1 MB

授权方式:公共开源     发布时间:2019-10-19

数据来源:Zeeshan-ul-hassan Usmani             数据语言:英文

数据介绍:

Zeeshan-ul-hassan Usmani的基因组表型SNPs原始数据

基因组学是分子生物学的一个分支,涉及基因组的结构,功能,变异,进化和绘图。有几家公司提供下一代人类基因组测序,从完整的30亿个碱基对到几千个表型SNP。使用23andMe(使用Illumina HumanOmniExpress-24)作为DNA的表型SNP。在这里为国际研究社区分享整个原始数据集

内容

姓名:Zeeshan-ul-hassan Usmani

年龄:38岁

出生国家:巴基斯坦

祖先的国家:印度(Utter Pradesh - UP)

File:GenomeZeeshanUsmani.csv

大小:15 MB

资料来源:23andMe个性化基因组报告

研究界仍在逐步在这一领域开展工作,专业人士一致认为基因组学仍处于起步阶段。您现在有机会通过数据集探索这个新的领域,并成为少数基因组学早期采用者之一。

数据集是从www.23andme.com提取的完整基因组,表示为由以下符号表示的SNP序列:A(腺嘌呤),C(胞嘧啶),G(鸟嘌呤),T(胸腺嘧啶),D (基本删除),I(基本插入)和'_'或' - '如果无法访问特定位置的SNP。它含有染色体1-22,X,Y和线粒体DNA。

有关可用的确切SNP(碱基对)及其数据集索引的完整列表,请访问 https://api.23andme.com/res/txt/snps.b4e00fe1db50.data。

 

相关链接

您可以使用以下人类基因组数据库站点获取帮助:

  • GenBank - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
  • 人类基因组计划 - https://www.genome.gov/hgp/
  • 基因组在线数据库(GOLD) - https://gold.jgi.doe.gov
  • 完整的基因组学 - http://www.completegenomics.com/public-data/

 

一些值得探索的想法:

  • 有问题的个人是否更容易患癌症?
  • 他是否会增加体重?
  • 他的出生地在哪里?
  • 哪个基因决定某些生物学特征(癌症易感性,脂肪生成率,头发颜色等)。
  • 这种表型SNP与来自西方世界的其他类似数据集相比如何?
  • 这个人死亡的可能原因是什么?
  • 这个人一生中最容易患病的疾病是什么?
  • 这个数据集有什么独特之处?
  • 在个人特质,智力水平,血统和身体构成方面,您还可以从这个数据集中提取什么?

 

下载地址:

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¤ 此数据集库仅供研究和教育用途,不得用于任何商业用途。
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